Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms