Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms