Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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