Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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