Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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