Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms