Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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CNGA3Q16281 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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CNGA3Q16281 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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