Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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