Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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UBE3CQ15386 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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UBE3CQ15386 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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