| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC109809.1-201 | ENST00000619665 | 545 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ISPD-AS1-202 | ENST00000438573 | 2252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ZNF807-201 | ENST00000328088 | 1707 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | DOCK7-204 | ENST00000454575 | 6985 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | PLS3-203 | ENST00000420625 | 3150 nt | TSL 5 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | PALMD-205 | ENST00000615664 | 1844 nt | TSL 5 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | HDX-206 | ENST00000506585 | 6158 nt | TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ELAVL2-204 | ENST00000397312 | 3805 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MTND5P24-201 | ENST00000438892 | 1767 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | TAB3P1-202 | ENST00000452645 | 1634 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU6-28P-201 | ENST00000362378 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RN7SKP280-201 | ENST00000364196 | 304 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL096678.1-201 | ENST00000438877 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL121871.1-201 | ENST00000443413 | 436 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | GJE1-201 | ENST00000450456 | 916 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MAST4-AS1-201 | ENST00000451496 | 777 nt | TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC097493.1-201 | ENST00000463958 | 372 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AP000563.1-201 | ENST00000490865 | 758 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SATB1-216 | ENST00000491519 | 1000 nt | TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC068657.1-201 | ENST00000520807 | 306 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | PIGY-201 | ENST00000527353 | 217 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | FAP-201 | ENST00000188790 | 2780 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL390862.1-201 | ENST00000635467 | 1469 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ATP2B1-203 | ENST00000393164 | 3127 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LIG4-205 | ENST00000614526 | 3884 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | VPS13C-203 | ENST00000395896 | 14579 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SLC35A1-201 | ENST00000369552 | 1851 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MAP3K7-202 | ENST00000369325 | 4633 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL022578.1-201 | ENST00000439330 | 1433 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ADAM18-206 | ENST00000520772 | 1429 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SOCS4-201 | ENST00000339298 | 6667 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ABCA5-208 | ENST00000588877 | 6525 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | CXCL10-201 | ENST00000306602 | 1176 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SNORD56.3-201 | ENST00000363507 | 71 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | Y_RNA.192-201 | ENST00000363977 | 102 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL359837.1-201 | ENST00000381357 | 287 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | EI24P2-201 | ENST00000397776 | 1076 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | U3.42-201 | ENST00000408746 | 214 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU2-43P-201 | ENST00000410306 | 190 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNA5SP293-201 | ENST00000410527 | 113 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL592310.1-201 | ENST00000414330 | 671 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | TPMTP2-201 | ENST00000414372 | 726 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC093578.1-201 | ENST00000415219 | 368 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | GRM7-AS1-201 | ENST00000420230 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ZMYM4-AS1-201 | ENST00000432683 | 459 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ATP5F1P1-201 | ENST00000433775 | 569 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | USP9YP24-201 | ENST00000434374 | 697 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC01757-201 | ENST00000435552 | 480 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC01423-202 | ENST00000436845 | 423 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | NOTCH2P1-201 | ENST00000443481 | 624 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | USP9YP17-201 | ENST00000444617 | 696 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ARPC3P5-201 | ENST00000448802 | 534 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC092155.2-201 | ENST00000454675 | 477 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC01075-201 | ENST00000455977 | 370 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU7-136P-201 | ENST00000458819 | 69 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |