Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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