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| FHL3 | Q13643 | DUXAP9-208 | ENST00000622815 | 614 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | CR381572.2-201 | ENST00000624852 | 397 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC055839.1-201 | ENST00000634467 | 498 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FHL3 | Q13643 | ZNF836-204 | ENST00000597252 | 3209 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.89-201 | ENST00000363031 | 102 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RNU6-387P-201 | ENST00000411331 | 105 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC00301-202 | ENST00000412599 | 772 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC009505.1-201 | ENST00000413151 | 424 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FHL3 | Q13643 | CR769775.2-201 | ENST00000417850 | 891 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC021713.1-201 | ENST00000526554 | 510 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC068587.5-201 | ENST00000528506 | 175 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | SDHAF2-203 | ENST00000534878 | 523 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC007527.1-202 | ENST00000543347 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL359237.1-202 | ENST00000556168 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC040958.1-201 | ENST00000561102 | 201 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC092718.6-202 | ENST00000563072 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC087501.4-201 | ENST00000574460 | 235 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | FAM60BP-201 | ENST00000578364 | 658 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC010591.1-201 | ENST00000603941 | 649 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL031320.1-201 | ENST00000604177 | 357 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC012443.1-201 | ENST00000605605 | 231 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC010133.1-201 | ENST00000615809 | 842 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | BX664730.1-201 | ENST00000616196 | 800 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL360181.4-201 | ENST00000621752 | 134 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | FER-210 | ENST00000628534 | 558 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC099654.5-201 | ENST00000636479 | 350 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | RPS6KA6-204 | ENST00000620340 | 8169 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | NDUFAF4-201 | ENST00000316149 | 2399 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF678-201 | ENST00000343776 | 8556 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |