Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms