Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms