Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
STRN3Q13033 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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STRN3Q13033 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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STRN3Q13033 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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STRN3Q13033 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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