Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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