Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPREP23469 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPREP23469 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPREP23469 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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