Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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