Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPROQ16827 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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