Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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GPNMBQ14956 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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