Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms