Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms