Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPREP23469 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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