Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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PTPRBP23467 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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