Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms