Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms