Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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