Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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FOXD1Q16676 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FOXD1Q16676 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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FOXD1Q16676 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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