Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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