Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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