Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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