Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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