Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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