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| RUNX3 | Q13761 | AP001360.2-201 | ENST00000534423 | 562 nt | TSL 4 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023050.2-201 | ENST00000544968 | 387 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF321P-202 | ENST00000550843 | 495 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133370.1-201 | ENST00000554679 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF5A2P1-201 | ENST00000564027 | 460 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009712.1-201 | ENST00000564938 | 316 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC006504.3-201 | ENST00000586818 | 523 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC093732.2-201 | ENST00000607950 | 274 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | CCDC82-201 | ENST00000278520 | 2941 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR1C1-202 | ENST00000641256 | 3719 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | YWHAZ-201 | ENST00000353245 | 2829 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA1109-203 | ENST00000388738 | 15574 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIQK-201 | ENST00000378861 | 1596 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRC39-203 | ENST00000370138 | 1466 nt | TSL 5 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TUBD1-214 | ENST00000592426 | 1460 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107081.3-201 | ENST00000612715 | 2034 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MKLN1-201 | ENST00000352689 | 11156 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.192-201 | ENST00000363977 | 102 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | ZNF603P-201 | ENST00000405613 | 487 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TANK-206 | ENST00000406287 | 875 nt | TSL 5 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00894-201 | ENST00000413076 | 403 nt | TSL 3 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00279-201 | ENST00000413486 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01676-201 | ENST00000420901 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006076.1-201 | ENST00000423233 | 345 nt | TSL 3 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL30P3-201 | ENST00000424262 | 333 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513175.1-201 | ENST00000431492 | 780 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH9-AS3-201 | ENST00000434073 | 479 nt | TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004837.2-201 | ENST00000435766 | 731 nt | TSL 3 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016644.1-201 | ENST00000438553 | 434 nt | TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP31-201 | ENST00000438855 | 1122 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GSAP-208 | ENST00000441833 | 737 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003001.1-201 | ENST00000443247 | 1135 nt | TSL 5 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELOCP23-201 | ENST00000452014 | 332 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087312.1-201 | ENST00000471411 | 480 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004263.1-201 | ENST00000479327 | 332 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083800.1-201 | ENST00000490594 | 246 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FCF1P3-201 | ENST00000496394 | 590 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBA6-AS1-204 | ENST00000502758 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097462.2-201 | ENST00000504623 | 481 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016687.2-201 | ENST00000504795 | 541 nt | TSL 5 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008885.1-201 | ENST00000514930 | 301 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-488P-201 | ENST00000515918 | 99 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR2114-201 | ENST00000516645 | 80 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001207.1-201 | ENST00000524051 | 481 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC079203.2-201 | ENST00000559867 | 387 nt | TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090695.1-201 | ENST00000561269 | 1222 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC145350.1-201 | ENST00000567426 | 208 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C15orf65-201 | ENST00000569691 | 729 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4738-201 | ENST00000579134 | 87 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBL5P2-201 | ENST00000583788 | 219 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYL12B-204 | ENST00000584539 | 1064 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021749.1-201 | ENST00000604322 | 607 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC048344.4-201 | ENST00000619744 | 527 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244205.2-202 | ENST00000635781 | 342 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNOT2-231 | ENST00000551483 | 4753 nt | TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF732-202 | ENST00000619749 | 2179 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEB-201 | ENST00000172853 | 20634 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090229.1-201 | ENST00000590983 | 1609 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCOC-203 | ENST00000394203 | 1999 nt | TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073130.1-201 | ENST00000457033 | 1958 nt | TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNF13-202 | ENST00000361785 | 1939 nt | TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF705G-201 | ENST00000400156 | 3644 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR1S2-201 | ENST00000302592 | 978 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP322-201 | ENST00000363617 | 119 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.500-201 | ENST00000384466 | 111 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC119751.3-201 | ENST00000399720 | 670 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-21P-201 | ENST00000410368 | 188 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZRANB2-AS2-201 | ENST00000411721 | 518 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107081.1-201 | ENST00000414975 | 361 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTP4A1P5-201 | ENST00000420305 | 455 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EDNRB-AS1-201 | ENST00000422405 | 601 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513174.1-201 | ENST00000423182 | 629 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC233981.1-201 | ENST00000423224 | 461 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02238-201 | ENST00000424953 | 557 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPRXP1-201 | ENST00000426312 | 460 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPP40P1-201 | ENST00000426762 | 456 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP82-202 | ENST00000427528 | 469 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105402.2-201 | ENST00000438503 | 358 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093155.1-201 | ENST00000440164 | 826 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007327.1-201 | ENST00000447461 | 264 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01810-201 | ENST00000450397 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO3P16-201 | ENST00000454456 | 754 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445488.1-201 | ENST00000457272 | 706 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CENPBD1P1-201 | ENST00000464061 | 469 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRG-AS1-202 | ENST00000466893 | 823 nt | TSL 4 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162742.2-201 | ENST00000472915 | 244 nt | TSL 5 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |