Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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