Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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SNTA1Q13424 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SNTA1Q13424 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SNTA1Q13424 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SNTA1Q13424 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SNTA1Q13424 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SNTA1Q13424 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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