Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms