Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RPA4Q13156 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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RPA4Q13156 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPA4Q13156 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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