Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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