Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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