Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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