Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRGP23470 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms