Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTIFO43310 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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