Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms