Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SPOCK3Q9BQ16 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms