Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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