Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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E2F4Q16254 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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