Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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HMGN3Q15651 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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