Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTPRRQ15256 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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