Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms