Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms