Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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